Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLIP2Q9UDT6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLIP2Q9UDT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLIP2Q9UDT6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms