Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ6

EXTL2, Exostosin-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL2Q9UBQ6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
EXTL2Q9UBQ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
EXTL2Q9UBQ6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
EXTL2Q9UBQ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms