Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN4

TRPC4, Short transient receptor potential channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC4Q9UBN4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRPC4Q9UBN4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRPC4Q9UBN4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRPC4Q9UBN4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms