Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM4

OPTC, Opticin, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTCQ9UBM4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
OPTCQ9UBM4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
OPTCQ9UBM4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
OPTCQ9UBM4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.4 ms