Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBH6

XPR1, Xenotropic and polytropic retrovirus receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPR1Q9UBH6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
XPR1Q9UBH6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
XPR1Q9UBH6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
XPR1Q9UBH6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
XPR1Q9UBH6 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms