Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
DNMT3BQ9UBC3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNMT3BQ9UBC3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNMT3BQ9UBC3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms