Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATXN10Q9UBB4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN10Q9UBB4 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms