Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KLHL13Q9P2N7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
KLHL13Q9P2N7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms