Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
KLHL42Q9P2K6 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLHL42Q9P2K6 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms