Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC43.59■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
CC2D2AQ9P2K1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC43.53■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC43.53■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.52■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CC2D2AQ9P2K1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC43.5■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC43.49■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC43.48■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC43.47■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.55
CC2D2AQ9P2K1 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC43.41■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC43.39■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
CC2D2AQ9P2K1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
CC2D2AQ9P2K1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
CC2D2AQ9P2K1 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms