Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J5

LARS, Leucine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARSQ9P2J5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LARSQ9P2J5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.76
LARSQ9P2J5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LARSQ9P2J5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms