Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
RRBP1Q9P2E9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RRBP1Q9P2E9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC36■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RRBP1Q9P2E9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RRBP1Q9P2E9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
RRBP1Q9P2E9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms