Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B2

PTGFRN, Prostaglandin F2 receptor negative regulator, humanhuman

Predictions only

Length 879 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRNQ9P2B2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGFRNQ9P2B2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGFRNQ9P2B2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms