Protein–RNA interactions for Protein: Q9P283

SEMA5B, Semaphorin-5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA5BQ9P283 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SEMA5BQ9P283 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SEMA5BQ9P283 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SEMA5BQ9P283 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms