Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.32■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.29■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.28■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
H2AFY2Q9P0M6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
H2AFY2Q9P0M6 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms