Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
VAPAQ9P0L0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
VAPAQ9P0L0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VAPAQ9P0L0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms