Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CCDC59Q9P031 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC59Q9P031 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CCDC59Q9P031 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms