Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DLL3Q9NYJ7 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
DLL3Q9NYJ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
DLL3Q9NYJ7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DLL3Q9NYJ7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms