Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
KLHL28Q9NXS3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KLHL28Q9NXS3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KLHL28Q9NXS3 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms