Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ING3Q9NXR8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ING3Q9NXR8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms