Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TMEM260Q9NX78 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TMEM260Q9NX78 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TMEM260Q9NX78 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms