Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX07

TRNAU1AP, tRNA selenocysteine 1-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNAU1APQ9NX07 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRNAU1APQ9NX07 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRNAU1APQ9NX07 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TRNAU1APQ9NX07 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms