Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATAD3AQ9NVI7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATAD3AQ9NVI7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATAD3AQ9NVI7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms