Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
UFSP2Q9NUQ7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UFSP2Q9NUQ7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms