Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN7

ACER3, Alkaline ceramidase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER3Q9NUN7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACER3Q9NUN7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACER3Q9NUN7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACER3Q9NUN7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
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