Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
GJB4Q9NTQ9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GJB4Q9NTQ9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GJB4Q9NTQ9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms