Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FARSBQ9NSD9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FARSBQ9NSD9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FARSBQ9NSD9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms