Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TM7SF3Q9NS93 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TM7SF3Q9NS93 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TM7SF3Q9NS93 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms