Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ1

C8orf17, Protein MOST-1, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf17Q9NRJ1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf17Q9NRJ1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf17Q9NRJ1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf17Q9NRJ1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
C8orf17Q9NRJ1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
C8orf17Q9NRJ1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
C8orf17Q9NRJ1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms