Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ARHGEF4Q9NR80 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ARHGEF4Q9NR80 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ARHGEF4Q9NR80 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ARHGEF4Q9NR80 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
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