Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CNGB3Q9NQW8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CNGB3Q9NQW8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CNGB3Q9NQW8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
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