Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRDM8Q9NQV8 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDM8Q9NQV8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDM8Q9NQV8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.9 ms