Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX9Q9NQ69 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LHX9Q9NQ69 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
LHX9Q9NQ69 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LHX9Q9NQ69 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LHX9Q9NQ69 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms