Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FANCFQ9NPI8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FANCFQ9NPI8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FANCFQ9NPI8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms