Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI0

TMEM138, Transmembrane protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM138Q9NPI0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TMEM138Q9NPI0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMEM138Q9NPI0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TMEM138Q9NPI0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.1 ms