Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG8

ZDHHC4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC4Q9NPG8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZDHHC4Q9NPG8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZDHHC4Q9NPG8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ZDHHC4Q9NPG8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC4Q9NPG8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ZDHHC4Q9NPG8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms