Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
GPCPD1Q9NPB8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GPCPD1Q9NPB8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GPCPD1Q9NPB8 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GPCPD1Q9NPB8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms