Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HMG20AQ9NP66 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
HMG20AQ9NP66 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.5 ms