Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
BRMS1Q9HCU9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
BRMS1Q9HCU9 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
BRMS1Q9HCU9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms