Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCC0

MCCC2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC2Q9HCC0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCCC2Q9HCC0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MCCC2Q9HCC0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MCCC2Q9HCC0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCCC2Q9HCC0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.5 ms