Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CENPJQ9HC77 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CENPJQ9HC77 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CENPJQ9HC77 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms