Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y6

POLR1B, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1BQ9H9Y6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
POLR1BQ9H9Y6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
POLR1BQ9H9Y6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
POLR1BQ9H9Y6 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms