Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Y2

RPF1, Ribosome production factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPF1Q9H9Y2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPF1Q9H9Y2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPF1Q9H9Y2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPF1Q9H9Y2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPF1Q9H9Y2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms