Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S4

CAB39L, Calcium-binding protein 39-like, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAB39LQ9H9S4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CAB39LQ9H9S4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAB39LQ9H9S4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAB39LQ9H9S4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms