Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9S0

NANOG, Homeobox protein NANOG, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGQ9H9S0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NANOGQ9H9S0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NANOGQ9H9S0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211.7 ms