Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9K5

ERVMER34-1, Endogenous retrovirus group MER34 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVMER34-1Q9H9K5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ERVMER34-1Q9H9K5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ERVMER34-1Q9H9K5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ERVMER34-1Q9H9K5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVMER34-1Q9H9K5 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVMER34-1Q9H9K5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVMER34-1Q9H9K5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ERVMER34-1Q9H9K5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ERVMER34-1Q9H9K5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms