Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C10orf88Q9H8K7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
C10orf88Q9H8K7 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms