Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E9

C8orf33, UPF0488 protein C8orf33, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf33Q9H7E9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf33Q9H7E9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf33Q9H7E9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf33Q9H7E9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf33Q9H7E9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf33Q9H7E9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
C8orf33Q9H7E9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
C8orf33Q9H7E9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
C8orf33Q9H7E9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
C8orf33Q9H7E9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192.7 ms