Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SH2D4AQ9H788 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SH2D4AQ9H788 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SH2D4AQ9H788 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms