Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4P4

RNF41, E3 ubiquitin-protein ligase NRDP1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF41Q9H4P4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF41Q9H4P4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RNF41Q9H4P4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF41Q9H4P4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF41Q9H4P4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms